MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 99348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013361	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853214
2	NC_013361	CAC	2	6	216	221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853214
3	NC_013361	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853215
4	NC_013361	CAGG	2	8	420	427	25 %	0 %	50 %	25 %	260853215
5	NC_013361	CT	3	6	445	450	0 %	50 %	0 %	50 %	260853215
6	NC_013361	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	260853215
7	NC_013361	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853215
8	NC_013361	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853215
9	NC_013361	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	260853215
10	NC_013361	CGC	3	9	570	578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853215
11	NC_013361	TCG	2	6	614	619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853215
12	NC_013361	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	260853215
13	NC_013361	ACT	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853215
14	NC_013361	CCG	2	6	849	854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853215
15	NC_013361	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853215
16	NC_013361	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853215
17	NC_013361	ACT	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853215
18	NC_013361	CGG	2	6	968	973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853215
19	NC_013361	GCTG	2	8	975	982	0 %	25 %	50 %	25 %	260853215
20	NC_013361	TTG	2	6	999	1004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853215
21	NC_013361	GGAC	2	8	1013	1020	25 %	0 %	50 %	25 %	260853215
22	NC_013361	GTT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853215
23	NC_013361	TTC	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853215
24	NC_013361	TGA	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853215
25	NC_013361	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853215
26	NC_013361	GC	3	6	1333	1338	0 %	0 %	50 %	50 %	260853215
27	NC_013361	GTG	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853215
28	NC_013361	ATC	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853215
29	NC_013361	TG	3	6	1435	1440	0 %	50 %	50 %	0 %	260853215
30	NC_013361	AAG	2	6	1484	1489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853215
31	NC_013361	GGT	2	6	1536	1541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853215
32	NC_013361	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853215
33	NC_013361	GAT	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853215
34	NC_013361	TCA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853215
35	NC_013361	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853215
36	NC_013361	CAA	2	6	1795	1800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853215
37	NC_013361	GCTG	2	8	1802	1809	0 %	25 %	50 %	25 %	260853215
38	NC_013361	GAA	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853215
39	NC_013361	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853215
40	NC_013361	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853215
41	NC_013361	CCAG	2	8	2003	2010	25 %	0 %	25 %	50 %	260853215
42	NC_013361	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853215
43	NC_013361	TAC	2	6	2098	2103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853215
44	NC_013361	GCG	2	6	2119	2124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853215
45	NC_013361	CGG	2	6	2134	2139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853215
46	NC_013361	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853215
47	NC_013361	TGA	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853215
48	NC_013361	GAT	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853215
49	NC_013361	ATTGAA	2	12	2431	2442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	260853215
50	NC_013361	TGC	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853215
51	NC_013361	CGA	2	6	2511	2516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853215
52	NC_013361	CG	4	8	2526	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	260853215
53	NC_013361	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853215
54	NC_013361	TGA	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853215
55	NC_013361	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853215
56	NC_013361	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853215
57	NC_013361	GCT	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853215
58	NC_013361	CTG	2	6	2764	2769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853215
59	NC_013361	GCG	2	6	2864	2869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853216
60	NC_013361	GGC	2	6	2917	2922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853216
61	NC_013361	CAA	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853216
62	NC_013361	GCAA	2	8	3030	3037	50 %	0 %	25 %	25 %	260853216
63	NC_013361	GGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853216
64	NC_013361	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	260853216
65	NC_013361	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853216
66	NC_013361	GGT	2	6	3245	3250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853216
67	NC_013361	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853216
68	NC_013361	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853216
69	NC_013361	CAT	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853216
70	NC_013361	CAGC	2	8	3283	3290	25 %	0 %	25 %	50 %	260853216
71	NC_013361	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853216
72	NC_013361	CGC	2	6	3386	3391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853216
73	NC_013361	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	260853216
74	NC_013361	TTCA	2	8	3428	3435	25 %	50 %	0 %	25 %	260853216
75	NC_013361	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853216
76	NC_013361	AGCG	2	8	3565	3572	25 %	0 %	50 %	25 %	260853216
77	NC_013361	TCCGGC	2	12	3578	3589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260853216
78	NC_013361	TG	3	6	3606	3611	0 %	50 %	50 %	0 %	260853216
79	NC_013361	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853216
80	NC_013361	T	6	6	3821	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	260853217
81	NC_013361	CTGA	2	8	3851	3858	25 %	25 %	25 %	25 %	260853217
82	NC_013361	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853217
83	NC_013361	TGA	2	6	3925	3930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853217
84	NC_013361	GC	3	6	3961	3966	0 %	0 %	50 %	50 %	260853217
85	NC_013361	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853217
86	NC_013361	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853217
87	NC_013361	TGA	3	9	4324	4332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853217
88	NC_013361	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853217
89	NC_013361	AGG	2	6	4437	4442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260853217
90	NC_013361	GTT	2	6	4457	4462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853217
91	NC_013361	CGG	2	6	4494	4499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853217
92	NC_013361	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853217
93	NC_013361	TGC	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853217
94	NC_013361	ACG	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853217
95	NC_013361	AAC	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853217
96	NC_013361	GTT	2	6	4675	4680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853217
97	NC_013361	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853217
98	NC_013361	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853217
99	NC_013361	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	260853217
100	NC_013361	CCG	2	6	4974	4979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853217
101	NC_013361	TGC	2	6	4984	4989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853217
102	NC_013361	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853217
103	NC_013361	ATC	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853217
104	NC_013361	TTA	2	6	5362	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853218
105	NC_013361	TGG	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853218
106	NC_013361	ACA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853218
107	NC_013361	CCG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853218
108	NC_013361	CCG	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853218
109	NC_013361	TCA	2	6	5482	5487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853218
110	NC_013361	ATC	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853218
111	NC_013361	CGG	2	6	5497	5502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853218
112	NC_013361	GCT	2	6	5688	5693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853219
113	NC_013361	GGA	2	6	5725	5730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260853219
114	NC_013361	TCA	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853219
115	NC_013361	AAG	2	6	5741	5746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853219
116	NC_013361	CAGT	2	8	5766	5773	25 %	25 %	25 %	25 %	260853219
117	NC_013361	AAT	2	6	5800	5805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853219
118	NC_013361	TCA	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853219
119	NC_013361	TTC	2	6	5867	5872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853219
120	NC_013361	TTC	2	6	5912	5917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853219
121	NC_013361	CAC	2	6	5959	5964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853219
122	NC_013361	TGC	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853219
123	NC_013361	TTG	2	6	5999	6004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853219
124	NC_013361	TGA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853219
125	NC_013361	AAATCG	2	12	6152	6163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	260853219
126	NC_013361	AGCG	2	8	6270	6277	25 %	0 %	50 %	25 %	260853219
127	NC_013361	CTG	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853219
128	NC_013361	GTG	2	6	6401	6406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853219
129	NC_013361	CAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853220
130	NC_013361	GGC	2	6	6570	6575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853220
131	NC_013361	GCC	2	6	6760	6765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853220
132	NC_013361	GTT	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853220
133	NC_013361	AGA	2	6	6831	6836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853220
134	NC_013361	ATC	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853220
135	NC_013361	CGC	2	6	7102	7107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853220
136	NC_013361	TGCCGC	2	12	7108	7119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260853220
137	NC_013361	CGC	2	6	7204	7209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853220
138	NC_013361	GCC	2	6	7210	7215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853220
139	NC_013361	GCCA	2	8	7227	7234	25 %	0 %	25 %	50 %	260853220
140	NC_013361	CAG	2	6	7387	7392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853220
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142	NC_013361	CG	3	6	7554	7559	0 %	0 %	50 %	50 %	260853220
143	NC_013361	AGA	2	6	7680	7685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853220
144	NC_013361	CGG	2	6	7701	7706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853220
145	NC_013361	CG	3	6	7746	7751	0 %	0 %	50 %	50 %	260853220
146	NC_013361	CAA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853220
147	NC_013361	TAA	2	6	7935	7940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853220
148	NC_013361	A	6	6	7946	7951	100 %	0 %	0 %	0 %	260853220
149	NC_013361	GCAT	2	8	7956	7963	25 %	25 %	25 %	25 %	260853220
150	NC_013361	ACC	2	6	8271	8276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853221
151	NC_013361	CAAC	2	8	8335	8342	50 %	0 %	0 %	50 %	260853221
152	NC_013361	TC	3	6	8346	8351	0 %	50 %	0 %	50 %	260853221
153	NC_013361	CGCAG	2	10	8360	8369	20 %	0 %	40 %	40 %	260853221
154	NC_013361	TTGA	2	8	8388	8395	25 %	50 %	25 %	0 %	260853221
155	NC_013361	CAG	2	6	8418	8423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853221
156	NC_013361	CG	3	6	8433	8438	0 %	0 %	50 %	50 %	260853221
157	NC_013361	CAG	2	6	8439	8444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853221
158	NC_013361	CGAC	2	8	8455	8462	25 %	0 %	25 %	50 %	260853221
159	NC_013361	TGC	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853221
160	NC_013361	AAG	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853221
161	NC_013361	CTG	2	6	8706	8711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853221
162	NC_013361	TTG	2	6	8770	8775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853221
163	NC_013361	AAGA	2	8	8811	8818	75 %	0 %	25 %	0 %	260853221
164	NC_013361	AGA	2	6	8831	8836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853221
165	NC_013361	TAC	2	6	8871	8876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853221
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167	NC_013361	GCTG	2	8	8990	8997	0 %	25 %	50 %	25 %	260853221
168	NC_013361	GCA	2	6	9086	9091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853221
169	NC_013361	A	6	6	9166	9171	100 %	0 %	0 %	0 %	260853221
170	NC_013361	CTG	2	6	9183	9188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853221
171	NC_013361	TGA	2	6	9304	9309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853222
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173	NC_013361	GAA	2	6	9390	9395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853222
174	NC_013361	ATC	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853222
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182	NC_013361	CAC	2	6	10011	10016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853223
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245	NC_013361	CTG	3	9	13330	13338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853226
246	NC_013361	TGA	2	6	13382	13387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853226
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249	NC_013361	CG	3	6	13559	13564	0 %	0 %	50 %	50 %	260853226
250	NC_013361	AGA	2	6	13652	13657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853226
251	NC_013361	CTT	2	6	13670	13675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853226
252	NC_013361	CTG	2	6	13786	13791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853226
253	NC_013361	GAA	2	6	13813	13818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853226
254	NC_013361	GAC	2	6	13840	13845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853226
255	NC_013361	ACTG	2	8	13866	13873	25 %	25 %	25 %	25 %	260853226
256	NC_013361	CAG	2	6	13969	13974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853226
257	NC_013361	CAG	3	9	13984	13992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853226
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259	NC_013361	TGT	2	6	14037	14042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853226
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261	NC_013361	A	6	6	14071	14076	100 %	0 %	0 %	0 %	260853226
262	NC_013361	ATT	2	6	14181	14186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853227
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366	NC_013361	A	7	7	22092	22098	100 %	0 %	0 %	0 %	260853232
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369	NC_013361	TCA	2	6	22147	22152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853232
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379	NC_013361	GCA	2	6	23223	23228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853234
380	NC_013361	TTC	2	6	23239	23244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853234
381	NC_013361	CTT	2	6	23276	23281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853234
382	NC_013361	CATA	2	8	23382	23389	50 %	25 %	0 %	25 %	260853235
383	NC_013361	AAG	2	6	23408	23413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853235
384	NC_013361	GT	3	6	23415	23420	0 %	50 %	50 %	0 %	260853235
385	NC_013361	CG	3	6	23461	23466	0 %	0 %	50 %	50 %	260853235
386	NC_013361	GAA	2	6	23485	23490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853235
387	NC_013361	GCGCAA	2	12	23493	23504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853235
388	NC_013361	GGTGAT	2	12	23511	23522	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260853235
389	NC_013361	TGCG	2	8	23638	23645	0 %	25 %	50 %	25 %	260853235
390	NC_013361	TCA	2	6	23684	23689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853235
391	NC_013361	TCT	2	6	23694	23699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853235
392	NC_013361	TGA	2	6	23736	23741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853235
393	NC_013361	TTA	2	6	23779	23784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853235
394	NC_013361	GCGT	2	8	23846	23853	0 %	25 %	50 %	25 %	260853235
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396	NC_013361	TCTGGC	2	12	23895	23906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853235
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401	NC_013361	AGC	2	6	24212	24217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853235
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405	NC_013361	TGA	2	6	24347	24352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853236
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409	NC_013361	A	7	7	24490	24496	100 %	0 %	0 %	0 %	260853236
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414	NC_013361	CCG	3	9	24701	24709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853236
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496	NC_013361	CTGG	2	8	29930	29937	0 %	25 %	50 %	25 %	260853240
497	NC_013361	ACG	2	6	30009	30014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853240
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499	NC_013361	CAG	2	6	30090	30095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853240
500	NC_013361	CGT	2	6	30121	30126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853240

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